D'abord appartenu a l'ordre de Saint-sylvestre, l'église se transforme avec les aides financières des Médicis qui participent à la rennovation de l'église et du couvent.
En 1490 arrive à Florence Savonarole et grâce a ses prêches qui terrorisent les florentins, il devient de plus en plus important pour le couvent et la ville. Son pouvoir se devellopera tellement qu'il prendra la tête du pouvoir politique et transformera même l'intérieur du palazzo vecchio.
Dans le couvent se trouvent des fresques de Beato Angelico, mais également une grande bibliothèque et la chapelle privée des Médicis.
